问：工程实际存在明显的质量问题，承包人以工程竣工验收合格证明等主张工程质量合格的，如何处理？

答：承包人交付的建设工程应符合合同约定交付条件及相关公司验收标准。工程质量存在明显的质量问题，承包人以工程竣工验收合格证明等主张工程质量合格的，人民法院不予支持。
在双方当事人已失去合作信任的情况下，为解决双方矛盾，人民法院可以判决由发包人自行委托第三方参照修复设计方案对工程质量予以整改，所需费用由承包人承担。
观点来源：江苏南通二建集团有限公司与吴江恒森房地产开发有限公司建设工程施工合同纠纷案--《最高人民法院公报》2014年第8期（总第214期）